БИОЛОГИЯ МОРЯ, 2020, том 46, № 5, с. 329-337

Разнообразие и антимикробная активность бактерий, выделенных из донных осадков Чукотского моря

© 2020 г. Л. А. Романенко¹, В. В. Куриленко¹, Н. Ю. Чернышева¹, К. В. Гузев¹, В. В. Михайлов^{1, 2}

¹Тихоокеанский институт биоорганической химии им. Г.Б. Елякова (ТИБОХ) ДВО РАН, Владивосток 690022, Россия;
²Дальневосточный федеральный университет, Владивосток 690950, Россия

E-mail:

Из образцов донных осадков Чукотского моря выделено и исследовано 248 штаммов гетеротрофных бактерий. На основании филогенетического анализа гена 16S рРНК были идентифицированы представители 33 родов, принадлежащие типам Proteobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes и Actinobacteria. Восемь групп бактерий показали уровень сходства гена 16S рРНК не более 97-98% и могут представлять новые таксоны. Скрининг антимикробной активности выявил 40 штаммов, способных ингибировать рост двух и более индикаторных микроорганизмов. Активные штаммы представлены бактериями родов Bacillus, Paenibacillus, Terribacillus, Virgibacillus (тип Firmicutes), Streptomyces, Pseudonocardia, Nocardiopsis (Actinobacteria) и в меньшей степени грамотрицательными бактериями родов Shewanella, Psychrobacter (класс Gammaproteobacteria), Massilia (класс Betaproteobacteria), Arenibacter (тип Bacteroidetes). Обнаружение фрагментов генов поликетидсинтаз (PKS-1) и нерибосомных пептидсинтетаз (NRPS) методом ПЦР с использованием вырожденных праймеров в 23 активных штаммах свидетельствует о том, что исследуемые бактерии могут служить источниками антимикробных метаболитов поликетидной природы и/или нерибосомных пептидов.

Ключевые слова: бактерии, филогения, гены 16S рРНК, PKS-1, NRPS, антимикробная активность, донные осадки, Чукотское море.